治理相關研究涉及到很多分子生物學實驗，此類實驗對于環境中雜質DNA的含量有比較高的要求。潔凈、無雜質核酸污染的實驗室，試驗成功率更高。德國MB公司生產的PCR Clean，能高效清除實驗環境中的雜質核酸污染，有助于提升分子實驗的穩定性。

人體腸道中包含非常多的微生物，這些微生物為包括質粒在內的可移動遺傳元件的接觸轉移提供了一個便利條件。質粒通常被定義為從宿主染色體上自主復制的染色體外元件。除了作為分子生物學的主力外，質粒通過提供諸如抗生素抗性、重金屬抗性、毒力因子或代謝功能等特性，加速微生物進化和增強宿主適應性的能力已被廣泛研究。

質粒一直是微生物學的一個主要焦點，不僅因為它們在分子生物學中的生物技術應用，而且因為它們在抗生素耐藥性基因的進化和傳播中的作用，這是一個日益增長的全球公共衛生問題。然而，存在著一組質粒，似乎沒有人們感興趣的遺傳功能，并且不包含編碼對其宿主明顯有益功能的基因。這種“隱質粒"通常很小且多拷貝，通常難以研究，因為它們缺乏任何可測量的表型或可選擇的標記。但這類質粒存在于廣泛的微生物分類中，并且分布在許多不同的環境中。

隱質粒的分析通常是在單一培養的細菌上進行的，這限制了對自然發生的微生物棲息地中其生態的了解。然而，宏基因組學和全新質粒預測算法的新進展，為彌合這一差距提供了強有力的手段。

例如，在近期的一項研究中，科研人員對來自人類腸道的68,000多個質粒進行了表征，并觀察到在地理不同人群數據集中普遍的參考質粒之一，是一種名為pBI143.44的隱質粒。科研人員通過組學和實驗方法對這種隱質粒進行了深入的表征，以研究其遺傳多樣性，宿主范圍，傳播途徑，對細菌宿主的影響，以及與人類健康和疾病狀態的關系。

相關研究發表在《Cell》上，文章標題為：“A cryptic plasmid is among the most numerous genetic elements in the human gut"。

該研究結果揭示了pBI143在人類腸道中的作用，其拷貝數至少比人類腸道中豐富的噬菌體之一——噬菌體crAssphage平均高出14倍。該項研究還證明了pBI143作為一種具有成本效益的生物標志物的潛力，可以評估微生物在人體腸道中所經歷的壓力程度，并作為一種量化環境樣本中人類糞便污染水平的敏感手段。