傳統的檢驗方法

傳統的阪崎腸桿菌分離檢測方法，依賴于生化和形態學特點，上通常以美國 FDA 頒布的“嬰兒配方奶粉中阪崎腸桿菌的分離計數”作為經典方法。2008年我國也制定了阪崎腸桿菌檢驗國家標準，并于2010 年、2016年進行了修訂，規范了阪崎腸桿菌檢測，目前依據我國食品安全國家標準食品微生物學檢驗GB4789.40—2016檢測阪崎腸桿菌。

檢驗程序：檢樣 100 g（mL）+ BPW 稀釋液 900mL→ 1 mL+Mlst-Vm→阪崎腸桿菌顯色培養基→挑取疑似菌落→TSA→挑取黃色菌→生化鑒定→報告。

阪崎腸桿菌顯色培養基，可選用上HiMedia公司生產的阪崎腸桿菌顯色培養基（貨號：MV1577），該培養基適用于從食物、牛奶和奶制品中分離鑒定阪崎克羅諾桿菌屬（阪崎腸桿菌），采用無瘋牛病風險的植物蛋白胨取代了動物蛋白胨，植物源成分，品質，值得信賴。若檢測進出口食品依據標準可選用另一款崎腸桿菌顯色培養基（貨號：MV1641），該培養基遵循ISO /TS 22964: 2006。

基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜檢驗法

基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜（MAL-DITOF- MS）法是將被測樣品以一定的比例與基質溶液相混合，利用脈沖激光照射激發基質，致使高分子生成分子離子以及分子離子的多聚體，在一時間飛行質譜儀中加速與檢測，結果被測高分子按質量數的大小進行分離，經過處理形成質量圖譜，通過軟件分析比較，篩選并確定出特異性(指紋) 圖譜，從而實現對目標微生物種或菌株的區分和鑒定。但分析成本高，儀器價格及日常維護費用貴。

分子生物學檢驗方法

目前用于乳制品中的阪崎腸桿菌的分子生物學檢驗方法包括普通PCR法（電泳法）、DNA環介導等恒擴增（LAMP）檢驗法和熒光 PCR 法等。這種方法克服了傳統檢驗方法的操作繁瑣、耗時長、不易分辨結果等缺點。也使得針對阪崎腸桿菌開展的快速檢測方法迅速發展。但采用該方法也存在需要樣品中測定菌濃度高、分析成本高、操作繁瑣，無法鑒定是否有活菌存在等缺點。